环氧灌封胶和有机硅橡胶两者之间最大的区别在于硬度不同，有机硅导热硅橡胶固化后胶体是软的，而环氧灌封胶与之大大相反，固化后硬度很高，而且其耐温性没有有机硅橡胶好。
环氧灌封胶的优点在于对材质的粘接力较好，保持较好的绝缘性，固化后呈透明状，具有较好的透光性。缺点在于抗冷热变化能力弱，受到冷热冲击后胶体容易产生裂缝，导致水汽从裂缝中渗入到电子元器件中。环氧灌封胶耐候性较差，光照或高温环境下容易黄变。
与之相比的有机硅橡胶，固化之后材质较软，固化后有固体橡胶和硅凝胶两种形态，在绝大多数应力下能够起到抗压、减震、保护的效果。
具有较好耐高低温性能，能在-55℃~260℃范围内长期工作。耐候性远远强于环氧灌封胶，在室外长达二十年以上仍能起到较好的保护作用，而且不易黄变。
与环氧树脂对比还有一个优点在于有机硅橡胶具备返修能力，当内部的电子元器件发生损坏或需要更换时，可以快捷的将其取出。而环氧树脂一旦灌封完成固化后，由于较高的硬度无法打开，无法实现元器件的更换。